Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TIMM29Q9BSF4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TIMM29Q9BSF4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms