Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C2orf88Q9BSF0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C2orf88Q9BSF0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C2orf88Q9BSF0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C2orf88Q9BSF0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C2orf88Q9BSF0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C2orf88Q9BSF0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C2orf88Q9BSF0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C2orf88Q9BSF0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C2orf88Q9BSF0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C2orf88Q9BSF0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C2orf88Q9BSF0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C2orf88Q9BSF0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms