Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UTP23Q9BRU9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
UTP23Q9BRU9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms