Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PYM1Q9BRP8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PYM1Q9BRP8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms