Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RHOXF2Q9BQY4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHOXF2Q9BQY4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms