Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREX2Q9BQ50 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TREX2Q9BQ50 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.5 ms