Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POP1Q99575 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POP1Q99575 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POP1Q99575 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POP1Q99575 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POP1Q99575 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POP1Q99575 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POP1Q99575 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms