Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LMTK3Q96Q04 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LMTK3Q96Q04 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms