Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEUROD6Q96NK8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms