Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KLHL15Q96M94 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL15Q96M94 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms