Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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SAMD8Q96LT4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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SAMD8Q96LT4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SAMD8Q96LT4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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