Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDHR1Q96JP9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR1Q96JP9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms