Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC136Q96JN2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC136Q96JN2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms