Protein–RNA interactions for Protein: Q96JK4

HHIPL1, HHIP-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPL1Q96JK4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPL1Q96JK4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPL1Q96JK4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPL1Q96JK4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPL1Q96JK4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPL1Q96JK4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPL1Q96JK4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPL1Q96JK4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPL1Q96JK4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPL1Q96JK4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HHIPL1Q96JK4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HHIPL1Q96JK4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HHIPL1Q96JK4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms