Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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