Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEIL1Q96FI4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NEIL1Q96FI4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms