Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYTL4Q96C24 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYTL4Q96C24 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms