Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM18Q96B42 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms