Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP13Q92995 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP13Q92995 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP13Q92995 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP13Q92995 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP13Q92995 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP13Q92995 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP13Q92995 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP13Q92995 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP13Q92995 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP13Q92995 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP13Q92995 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP13Q92995 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP13Q92995 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP13Q92995 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP13Q92995 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP13Q92995 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP13Q92995 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP13Q92995 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP13Q92995 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP13Q92995 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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