Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KIFAP3Q92845 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms