Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PHF3Q92576 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms