Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C4orf3Q8WVX3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C4orf3Q8WVX3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms