Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC7Q8WUI4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDAC7Q8WUI4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms