Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEDD1Q8NHV4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD1Q8NHV4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms