Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM58Q8NG06 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms