Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF397Q8NF99 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms