Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CARMIL3Q8ND23 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CARMIL3Q8ND23 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms