Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC191Q8NCU4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC191Q8NCU4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms