Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C17orf53Q8N3J3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C17orf53Q8N3J3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms