Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GPC2Q8N158 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GPC2Q8N158 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms