Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HACE1Q8IYU2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HACE1Q8IYU2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms