Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC50Q8IVM0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC50Q8IVM0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms