Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NPM2Q86SE8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NPM2Q86SE8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms