Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT27Q7Z3Y8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRT27Q7Z3Y8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRT27Q7Z3Y8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms