Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HS2ST1Q7LGA3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HS2ST1Q7LGA3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms