Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q7L0L9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q7L0L9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q7L0L9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q7L0L9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q7L0L9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q7L0L9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q7L0L9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q7L0L9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q7L0L9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q7L0L9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Q7L0L9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q7L0L9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q7L0L9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q7L0L9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q7L0L9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms