Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSH2Q76I76 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSH2Q76I76 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SSH2Q76I76 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SSH2Q76I76 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SSH2Q76I76 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SSH2Q76I76 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SSH2Q76I76 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SSH2Q76I76 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SSH2Q76I76 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSH2Q76I76 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSH2Q76I76 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SSH2Q76I76 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms