Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CWC27Q6UX04 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CWC27Q6UX04 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms