Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC171Q6TFL3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms