Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC174Q6PII3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC174Q6PII3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms