Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LETMD1Q6P1Q0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
LETMD1Q6P1Q0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms