Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAAP20Q6NZ36 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms