Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCSAPQ6IQ19 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCSAPQ6IQ19 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms