Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM236Q5W0B7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM236Q5W0B7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms