Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GARNL3Q5VVW2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GARNL3Q5VVW2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms