Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM78BQ5VT40 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms