Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOGA3Q5TF21 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOGA3Q5TF21 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms