Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CELF3Q5SZQ8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms