Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
XKR3Q5GH77 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XKR3Q5GH77 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms