Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALFQ53S48 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALFQ53S48 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms